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同治皇帝和光绪皇帝的关系使堂兄弟与表兄弟的关系，同治皇帝的父亲和光绪皇帝的父亲是亲兄弟，同治皇帝的母亲和光绪皇帝的母亲是亲姐妹。
同治皇帝去世后，慈禧等人拥立了光绪作为大清王朝的继承人。1874年，年仅十九岁的同治皇帝去世，同治皇帝生前没有留下子嗣，于是两宫皇太后就商议立储君一事，参加大会的都是同治皇帝的叔叔们，除此之外还有清朝廷的大臣。在选帝一事中，慈禧太后和军机大臣们发生了很大的争议，慈禧太后为了稳定自己的统治权，便决定立醇亲王和自己亲妹妹的儿子，就是年仅四岁的载湉为皇帝。慈禧太后，决定将载湉过继给咸丰帝，那么载湉就是同治皇帝的弟弟，这样一来，朝廷的统治权还是把握在慈禧太后手上。醇亲王知道载湉被立为皇帝时，顿时大哭，但是没有办法，四岁的载湉就这样被拉上了政治舞台。
载湉被接入皇宫，成为了大清王朝第11位皇帝，在他6岁的时候就已经读书，当时夏同善为载湉的老师之一，叫他礼乐骑射。载湉读书十分刻苦，父亲醇亲王就在毓庆宫照顾他。
载湉当上皇帝之后，慈禧太后以他年幼为理由，开始了垂帘听政。1887年，光绪皇帝开始了亲政，但是慈禧太后仍要过问国事，大小事情都要给她报备。
后来，清朝内忧外患，联军攻打清政府，光绪拒绝求和，在政事问题上和慈禧太后有很大的分歧。为了挽救积贫积弱、摇摇欲坠的清朝统治，光绪接受了康有为等人的维新变法运动，这一行为遭到慈禧太后的反对和干预。
同治的皇后是孝哲毅皇后，孝哲毅皇后比同治皇帝大两岁，十九岁的时候嫁给了同治皇帝。当初慈禧太后为载淳选妃时，喜欢凤秀的女儿，而载淳喜欢阿鲁特氏，慈禧太后便依从了同治皇帝的意愿，立了阿鲁特氏为皇后，即孝哲毅皇后。
同治皇帝十分喜欢阿鲁特氏，而慈禧不喜欢阿鲁特氏，同治皇帝和孝哲毅皇后感情十分要好，对于慈禧太后喜欢的秀女们，同治皇帝常常冷落他们，专宠孝哲毅皇后一人，慈禧十分生气，还常常干预同治皇帝的后宫生活。后来，在野史中，关于孝哲毅皇后之死，有人说孝哲毅皇后遭到慈禧的迫害，才去世的。
同治皇帝因为天花不治而亡，同治皇帝去世时，孝哲毅皇后已经怀有身孕，慈禧太后为了保住自己的权力和地位，便命令逼迫孝哲毅皇后喝药自尽。慈禧担心，如果孝哲毅皇后生下皇子后，她就是皇太后，而孝哲毅皇后的儿子成为皇帝后，孝哲毅皇后就有了执政大权。想到这儿，慈禧太后为了不让自己退于幕后，便逼迫孝哲毅皇后喝药自杀。慈禧太后，不喜欢孝哲毅皇后的另一个原因便是，据说慈禧因为小事就喜欢对孝哲毅皇后掌嘴，孝哲毅皇后对慈禧太后说，自己是同治皇帝明媒正娶的正室，不可以遭受这样的屈辱，孝哲毅皇后的话刺痛了慈禧的痛处。因为慈禧太后不是从大清门进宫，这一点是慈禧太后十分记恨的，所以慈禧太后认为孝哲毅皇后的话是在讽刺自己，所以对她更是憎恨。
同治皇帝死后不久，孝哲毅皇后便去世了，年仅二十二岁。
对于载淳皇帝的死，尽管清代宫廷史料，特别是档案内均有较明确的记载。但在一些私人著述和笔记中，还是提出了各种不同的说法，并添加了一些演义性的描绘，有的说他死于天花，有的说他死于梅毒，也有的说他死于疥疮，众说纷纭，莫衷一是。
濮兰德、巴克斯著《慈德外纪》中记载：“私家著述，皆谓太后纵帝游荡，及至得疾，又不慎重爱护，以至深沈不起，……盖帝常履饮于外，至翌晨召见军机时犹未归也，或醉中言语失次，杂以南城猥贱之事，1873年(即同治12年)外间皆窃窃私议恐帝寿之不久。至次年12月，帝得痘症，不能临朝，两宫皇太后代执国政。至月底帝遂降谕日：‘朕于本月有天花之喜”。
《四朝佚闻》中记载：“同治帝(穆宗)之崩，传者不一，或云天花，或云内毒，而医药不能尽合……”这些著述除了记载同治皇帝的病情死因之外，还特意说明了同治皇帝南郊微服履行之事，并且把这件事与同治皇帝母子矛盾及病和死联系在一起，说明由于西太后专权，同治帝忧郁不快之情。但是，在慈禧的监视之下，仅有几个太监夜间常出没于宫禁森严的大内，至整夜不归，竟达次晨来不及召见军机大臣或醉语胡言的程度似难出现。
其实，同治皇帝的病情和死因，可以从清代皇帝“脉案档簿”中看得一清二楚。《万岁爷进药底簿》中详细记录了自同治13年10月30日未刻载淳得病至同年十二月初五日酉刻死去前后36天的脉案、病情和用药情况，它完全证明了同治帝载淳最后死于天花。
这是详实可靠的。1979年中国第一历史档案馆、中医研究院和北京医院的有关专家教授，对清穆宗同治帝的病情发展及用药情况进行了专门的研讨，大家的结论仍认为同治皇帝死于天花是无疑的。
不管怎样，同治帝载淳只活了短短的19岁。他的一生是一个悲剧。
载淳皇帝是清朝历史上死的最早的皇帝，也是很多影视作品中会描写比较多的皇帝，大多数还是描写因性病而死。最终虽然清朝官方保持沉默，但是从各种史料几率和保存的资料来看，我们还是要帮载淳皇帝要平反一下，是死于天花。
